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照亮了折叠更高沐鸣登录网址层次折纸的道路


 
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折纸听起来更像是艺术而不是科学,但分子生物学家利用了一种蛋白质用来确定其形状的复杂折叠途径,使他们能够构建一些迄今为止最复杂的合成蛋白质纳米结构。
 
在DESY公司的PETRA III同步加速器上,使用EMBL汉堡公司的世界级光束线P12,斯洛文尼亚的一个研究团队,与EMBL公司的Svergun集团合作,将强大的x射线束定向到被称为“卷卷折纸”的人造蛋白质上。这些蛋白质被设计成一种特定的形状,沐鸣登录网站基于成对相互作用的短模块。通过确定它们在EMBL光束线上的分子结构,研究人员确认了蛋白质折叠成所需的形状,然后一步一步地研究自组装过程。这些发现促进了对合成的类似折纸的蛋白质折叠如何潜在地传递治疗方法的理解,使更精确地靶向药物,最小化副作用,最大化疗效成为可能。
 
“最近科学家们意识到,天然蛋白质只代表了可能的蛋白质形状的很小一部分,我们可以使用不同于天然蛋白质的设计原则。我们可以定制设计的蛋白质来制造新材料,输送药物和疫苗,以及更多,”罗曼·杰拉拉说,他是斯洛文尼亚卢布尔雅那国家化学研究所的合成生物学家,他领导了这项工作,用不同类型的人工蛋白质链设计并建造了一个双金字塔(由两个相连的三角形金字塔组成的钻石形状)。
 
当科学家们第一次尝试用DNA做折纸时,蛋白质有更多的潜在应用。蛋白质是生命的分子机器,含有氨基酸的长链,这些氨基酸可折叠成特定的形状,以发挥其特定的功能。这可能意味着增强免疫力,与其他细胞交流,或执行其他任务来保持身体健康。这项研究中使用的蛋白质被折叠成一种叫做盘绕的编织绳,它很容易与同一链的其他部分或其他分子结合。这使得它们成为制作定制纳米结构的绝佳建筑材料。
 
罗曼的团队首先用一种更简单的折纸结构成功地完成了这一探索——一个带有三角形基底的单金字塔。他们检查了一条由特定顺序的氨基酸组成的蛋白质链, 杏耀娱乐信誉如何 ,观察它是如何自我组装的。然后,是时候把它从一个结构转换成另一个结构了,就好像一个折纸莲花可以转换成一个起重机。他们把两条不同的氨基酸链放在一起,这些氨基酸链携带着一种叫做蛋白酶的剪刀酶的信号,告诉它在“折纸”蛋白质中哪里要切。通过这样做,他们成功地迫使蛋白质进行折纸式转化,变成不同的形状。
 
用光线照射蛋白质溶液
 
要做这类工作,研究人员需要高科技工具。EMBL汉堡公司的波束线P12特别适合于这一目的,EMBL公司的Svergun集团以其在小角度x射线散射(SAXS)技术方面的专业知识而闻名于世。自2018年以来,EMBL科学家一直在与斯洛文尼亚的研究小组合作,支持他们使用SAXS来研究折纸蛋白的结构。
 
“在SAXS中,我们用x射线照射含有蛋白质溶液的玻璃毛细管。当x射线在穿过溶液时散射时,我们就有了一种解释结构的方法,”小组组长德米特里·斯韦根说。“在这里,大多数数据收集工作都是自动化的,我们还提供重要的软件和分析支持,就像这样的合作。”
 
使用EMBL光束线,连同电子显微镜、量热法、计算模型和其他方法,研究人员汇集了识别折纸蛋白结构所需的数据,并确认其形状符合他们的整体折纸设计。

“我们的工作是从光束线中获得最佳信号,并为获取数据创造最佳条件,”斯vergun小组的博士后Stefano Da Vela说。“我们提供工具来帮助理解SAXS实验数据,并根据数据创建3D模型。”
 
研究人员观察到,它们的合成蛋白质是“自下而上”组装的,这意味着小而精细的片段先形成,然后组装成一个更大的结构。理解这一点将有助于研究人员以更精确的方式构建更复杂的蛋白质折纸结构。“一枝分析是识别的关键设计导致所需的形状,和一流的工具开发EMBL的允许我们检测我们的笼子里设计的特色,”法比奥Lapenta说化学研究所的博士后和他们最近的一篇论文的主要作者自然通信描述这项工作。“线圈是很好的工具,沐鸣登录网址既可以用于细胞,也可以用于分离的蛋白质。我们认为,我们可以扩展卷曲蛋白折纸的潜力,设计出许多新的蛋白质折叠,并引入有趣的功能。”

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